ENGLISH- Inicio
- Programa
- Consideraciones previas
- Sesión 1: Linux
- Sesión 2: Estadística para Bioinformática
- Sesión 3: Programación en R para Bioinformática
- Sesión 4: Práctico Familiarización con R
- Sesión 5: Introducción a los análisis omicos
- Sesión 6: Análisis funcional de datos omicos
- Sesión 7: Práctico de análisis de datos propios
6-9 agosto y 21-23 de agosto
Semana 1
Sesión 1: Linux . 6 agosto 14:00 – 17:00, sala biblioteca, piso 5, edificio 210, UC Casa Central. Instructores: Paulo Canessa y Jonathan Maldonado.
- Comandos básicos
- Conectarse a terminales
- Instalar programas
- Tipos de archivos datos omicos
- Estadística clásica: hipótesis nula, hipótesis alternativa, valores p.
- Test clásicos, anova etc
- Diseño experimental
- Corrección por múltiples comparaciones: valores p ajustados.
- Estadística bayesiana: Teoría de decisión y probabilidades a posteriori.
- Introducción a la programación en R y uso RStudio.
- Tipos de variables: vectores, matrices, factores, data frames, listas.
- Scripts Flujos de control y condicionales, loops, Funciones, familia apply.
- Transcriptómica de modelos
- Trabajo con archivos FASTA, FASTQ, BAM, BED, csv, txt.
- Análisis de expresión diferencial
- Mapeo de secuencias con kallisto.
- Práctico: Análisis estadístico de expresión diferencial
- Redes de Co-expresión génica. Redes de Interacción TF-target .
- Análisis estadístico de Redes Biológicas.
- Uso de bases de datos Anotaciones Funcionales: Gene Ontology (GO), KEGG.
- Práctico en R/Bioconductor
- Práctico en Cytoscape
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