- Inicio
- Programa
- Consideraciones previas
- Sesión 1: Linux
- Sesión 2: Estadística para Bioinformática
- Sesión 3: Programación en R para Bioinformática
- Sesión 4: Práctico Familiarización con R
- Sesión 5: Introducción a los análisis omicos
- Sesión 6: Análisis funcional de datos omicos
- Sesión 7: Práctico de análisis de datos propios
- Transcriptómica de modelos
- Trabajo con archivos FASTA, FASTQ, BAM, BED, csv, txt.
- Análisis de expresión diferencial
- Mapeo de secuencias con salmon
- Práctico: Análisis estadístico de expresión diferencial
Material:
- Ejemplo básico de cuantificación para análisis de RNAseq
- Informe Salmon+DESeq2 de A. thaliana con 1 millón de reads por librería
- Informe Salmon+DESeq2 de A. thaliana con todos los reads
- Informe Salmon+DESeq2 de S. cerevisiae con 1 millón de reads por librería
- Informe Salmon+DESeq2 de S. cerevisiae con todos los reads
- Diapositivas de apoyo en formato PPTX, Jonathan Maldonado
- Archivo con comandos utilizados, DESeq2 (versión .html con gráficos)