Workshop iBio III: Introducción al Análisis de RNA-seq en R

 
Este workshop tiene como finalidad capacitar a los miembros del Instituto en el lenguaje de programación R, con el objetivo de usar esta herramienta para analizar datos de RNA-seq. Consiste en 4 sesiones que se realizarán entre el 7 y 15 de Mayo.
 
El workshop empezará con una sesión donde se responderán preguntas relacionadas con el uso básico de R, continuando con un taller de diseño de gráficos en R. La segunda parte del workshop se enfocará en el análisis de datos transcriptómicos. Durante 3 días, los asistentes aprenderán a realizar análisis de expresión diferenciada de datos de RNA-seq obtenidos a partir de distintos diseños experimentales, incluyendo la generación de redes transcripcionales.
 
 
Prerequisito
 
Este workshop requiere que los asistentes auditen este curso online de manejo básico de R. El curso tiene una duración estimada de 4 semanas.
 
 
Programa
 
Sesión 1: Básicos de R.  Por confirmar
  • Consultas curso online de R
 
Sesión 2: Taller de gráficos en R.  Por confirmar
  • Funciones básicas de gráficos
  • Ggplot
  • Heatmaps
 
Sesión 3: Análisis de datos transcripcionales I. Por confirmar
  • RNA-Seq: pre-procesamiento de datos.
  • Análisis temporal de datos transcripcionales.
 
Sesión 4: Análisis de datos transcripcionales II. Por confirmar
  • Análisis de datos transcripcionales, efecto del tratamiento.  (mañana)
  • Análisis de datos transcripcionales con multiples variables. (tarde)
 
Sesión 5: Análisis de datos transcripcionales III. Por confirmar
  • Generación de redes transcripcionales.