Workshop iBio: Introducción al Análisis de RNA-seq en R

La cuarta versión de este workshop, al igual que la anterior, tiene como finalidad capacitar a los miembros del Instituto en el lenguaje de programación R, con el objetivo de usar esta herramienta para analizar datos de RNA-seq.

La primera parte del curso consiste en 4 sesiones, que se realizarán entre el 22 de abril y el 13 de mayo de 2022, y tratará sobre el uso básico de R, continuando con un taller de diseño de gráficos en R.

La segunda parte del workshop se enfocará en el análisis de datos transcriptómicos. Desde el 27

de mayo y 17 de junio de 2022, los asistentes aprenderán a realizar análisis de expresión diferenciada de datos de RNA-seq obtenidos a partir de distintos diseños experimentales, incluyendo la generación de redes transcripcionales.

Instructores:

• Jonathan Maldonado, PhD
• Nate Johnson, PhD
• Pablo Villarreal, PhD
• Tomás Moyano, PhD

Prerequisito

La primera parte de este workshop requiere que los asistentes auditen dos cursos online de manejo básico de R. Si ya manejas R, NO ES NECESARIO que audites estos cursos, pero tendrás que poner a prueba tu conocimiento llevando a cabo la primera tarea del Workshop, para poder continuar con los módulos de transcriptómica.

R basics:  https://courses.edx.org/courses/course-v1:HarvardX+PH125.1x+1T2020/course/

R visualization: https://courses.edx.org/courses/course-v1:HarvardX+PH125.2x+2T2020/course/

Programa

• Viernes, 22 de Abril 11:00hrs – Q&A Section1&2: R Basics
• Viernes, 29 de Abril 11:00hrs – Q&A Section3&4: R Basics
• Viernes, 6 de Mayo 11:00hrs – Q&A Section1&2&3: R Visualization
• Viernes, 13 de Mayo 11:00hrs – Q&A Section4&5: R Visualization & R Markdown
• Viernes, 20 de Mayo 10:00hrs Tarea 1
• Viernes, 27 de Mayo 11:00hrs – Q&A Section1: RNAseq Data Preprocessing
• Viernes, 3 de Junio 11:00hrs – Q&A Section2: Temporal analysis of RNA-seq data
• Viernes, 10 de Junio 11:00hrs – Q&A Section3: Treatment_and_Multivariables
• Viernes, 17 de Junio 11:00hrs – Q&A Section4: Transcriptional Networks
• Viernes, 24 de Junio 10:00hrs Tarea 2

 

Postulaciones hasta el 12 de abril aquí