Workshop VIII iBio: Introducción al Análisis de RNA-seq en R

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La quinta versión de este workshop tiene como objetivo desarrollar capacidades bioinformáticas en la comunidad científica, a través del lenguaje de programación R, con el objetivo de usar esta herramienta para analizar datos de RNA-seq.

La primera parte del curso consiste en 4 sesiones, que se realizarán entre el 19 de mayo y el 23 de junio de 2023, y tratará sobre el uso básico de R y visualización de datos en R.

La segunda parte del workshop se enfocará en el análisis de datos transcriptómicos. Desde el 7 de julio  y 28 de julio 2023, los asistentes aprenderán a realizar análisis de expresión diferenciada de datos de RNA-seq obtenidos a partir de distintos diseños experimentales, incluyendo la generación de redes transcripcionales.

 

Instructores:
  • Jonathan Maldonado, PhD
  • Nate Johnson, PhD
  • Pablo Villarreal, PhD
  • Tomás Moyano, PhD

 

Prerequisito

La primera parte de este workshop requiere que los asistentes auditen dos cursos online de manejo básico de R. Si ya manejas R, NO ES NECESARIO que audites estos cursos, pero tendrás que poner a prueba tu conocimiento llevando a cabo la primera tarea del Workshop, para poder continuar con los módulos de transcriptómica.

R basics:  https://courses.edx.org/courses/course-v1:HarvardX+PH125.1x+1T2020/course/

R visualization: https://courses.edx.org/courses/course-v1:HarvardX+PH125.2x+2T2020/course/

 

Programa
Postulaciones hasta el 15 de Mayo
  • Viernes, 19 de mayo envío de información para comenzar a auditar el curso EDX R Basics
  • Viernes, 26 de mayo 11:00 hrs – Q&A Section1&2: R Basics
  • Viernes, 2 de junio 11:00 hrs – Q&A Section3&4: R Basics
  • Viernes, 9 de junio 11:00 hrs – Q&A Section 1 & 2 & 3: R Visualization
  • Viernes, 16 junio 11:00 hrs – Q&A Section 4 & 5: R Visualization & R Markdown
Viernes, 16 de junio tarea 1
Viernes, 23 de junio entrega tarea 1
  • Viernes, 7 de julio 11:00 hrs – Q&A Section1: RNAseq Data Preprocessing
  • Viernes, 14 de julio 11:00 hrs – Q&A Section2: Temporal analysis of RNA-seq data
  • Viernes, 21 de julio 11:00 hrs – Q&A Section3: Treatment_and_Transcriptional Networks

Viernes, 21 de julio se les envía tarea 2
Viernes, 28 de julio entrega tarea 2

 

Postulaciones hasta el 15 de mayo aquí

 

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