Workshop iBio IV: Introducción al Análisis de RNA-seq en R

La segunda versión de este workshop, al igual que la anterior, tiene como finalidad capacitar a los miembros del Instituto en el lenguaje de programación R, con el objetivo de usar esta herramienta para analizar datos de RNA-seq.

La primera parte del curso consiste en 6 sesiones, que se realizarán entre el 4 de septiembre y el 9 de octubre de 2020, y tratará sobre el uso básico de R, continuando con un taller de diseño de gráficos en R.

La segunda parte del workshop se enfocará en el análisis de datos transcriptómicos. Desde el 26 de octubre al 16 de noviembre de 2020, los asistentes aprenderán a realizar análisis de expresión diferenciada de datos de RNA-seq obtenidos a partir de distintos diseños experimentales, incluyendo la generación de redes transcripcionales.

Prerequisito

La primera parte de este workshop requiere que los asistentes auditen dos cursos online de manejo básico de R. Si ya manejas R, NO ES NECESARIO que audites estos cursos, pero tendrás que poner a prueba tu conocimiento llevando a cabo la primera tarea del Workshop, para poder continuar con los módulos de transcriptómica.

R basics:  https://courses.edx.org/courses/course-v1:HarvardX+PH125.1x+1T2020/course/

R visualization: https://courses.edx.org/courses/course-v1:HarvardX+PH125.2x+2T2020/course/

Programa

Viernes, 4 de Septiembre: Q&A Session 1: R Basics
Viernes, 11 de Septiembre: Q&A Session 2: R Basics
Jueves, 17 de Septiembre: Q&A Session 3: R Basics
Viernes, 25 de Septiembre: Q&A Session 4: R Basics
Viernes, 2 de Octubre: Q&A Session 2&3: R Visualization
Viernes, 9 de Octubre: Q&A Session 4&5: R Visualization & R Markdown
Lunes, 19 de Octubre, Tarea 1
Lunes, 26 de Octubre: Q&A Session 1: RNAseq Data Preprocessing
Lunes, 2 de Noviembre: Q&A Session 2: Temporal analysis of RNA-seq data
Lunes, 9 de Noviembre: Q&A Session 3: Treatment_and_Multivariables
Lunes, 16 de Noviembre: Q&A Session 4: Transcriptional Networks
Viernes, 27 de Noviembre, Tarea 2