Workshop II iBio: Bioinformática

El primer Workshop Bioinformático iBio tiene por obtivo familiarizar a los miembros del Instituto con herramientas computacionales cada vez más utilizadas en distintos modelos biológicos. El workshop comenzará con una introducción básica a linux, en donde los participantes podrán aprender comandos básicos para manipular archivos, incluyendo la instación de programas. En la segunda sesión, los partipantes asistirán a una clase teórica de estadística relevante en aspectos bioinformáticos, para proseguir en la sesión siguiente destinada a la introducción en R, revisando variables, funciones, loops y otro, incluyendo programación básica. Se incluye una sesión completa práctica en R. La segunda mitad del worshop está destinado a análisis transcriptómico. Se incluye una sesión de mapeo de archivos FASTQ y expresión diferencial, seguida de una sesión de análisis funcional de datos de expresión, incluidas redes de Co-expresión génica, para finalizar con una sesión práctica de datos propios de cada uno de los participantes

Ciencia y Cerveza

ESCUELA CIENCIA Y CERVEZA, SANTIAGO CHILE

La escuela de Ciencia y Cerveza tendrá una segunda versión a desarrollarse en la Pontificia Universidad Católica de Chile este 16-17 de Agosto 2019 y organizada enteramente por el Instituto Milenio de Biología Integrativa, iBio.

Los asistentes podrán tomar tres cursos a los cuales se deben inscribir: 1) Levaduras Cerveceras y su Manejo en Fábrica; 2) Re-utilización de Levaduras y 3)Estrategias de control de calidad en fábricas cerveceras artesanales.

Las inscripciones estarán abiertas hasta el 25 de Julio y puedes registrarte en el siguiente link: 
https://forms.gle/kfJL7Nj24V41qqN26.
Después del 25 de Julio se hará una selección de los inscritos en base a descripción de intereses y se les comunicará si fueron aceptados en la escuela. Los que sean aceptados deberán depositar a transferir la suma de 20 mil pesos, para reservar su cupo, luego terminada la escuela y asistido a los tres será devuelto del dinero. Faltar a uno o más cursos es causal de la no devolución del dinero, esto para asegurar el correcto uso del cupo otorgado.
Los cursos serán impartidos de manera conjunta con el Programa Internacional Ciencia y Cerveza del Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales (IPATEC, Bariloche, Argentina). Las clases estarán a cargo del Dr. Diego Libkind, del IPATEC.

Curso 1: Levaduras Cerveceras y su Manejo en Fábrica
Curso teórico a cargo del Dr. Diego Libkind. Duración: 4 hs. 30 min.
Objetivo:
El mismo está dirigido a productores, profesionales, entusiastas y técnicos del sector, teniendo como objetivo transmitir conocimientos teóricos que contribuyan a un mejor entendimiento de las levaduras cerveceras, propiciando así, y a través del uso adecuado de las mismas, una mejora en la calidad, productividad, rentabilidad y diferenciación productiva. Se trata de una capacitación avanzada orientada a microcerveceros y que supone conocimientos previos sobre cuestiones básicas de manejo de levaduras.
Temas:

  • Repaso de cuestiones básicas de levaduras y su manejo en fábrica (nivelación).
  • Levaduras domesticadas vs salvajes. Levadura cervecera… ¿una levadura más?
  • Características de los distintos formatos de levaduras cerveceras.
  • Lo que se viene: Levaduras no convencionales = cervezas no convencionales
  • Compuestos de sabor y aroma de la levadura: ¿Por qué hacen lo que hacen?
  • Control y optimización del proceso fermentativo: una deuda pendiente
  • Eligiendo mi levadura: haciendo la diferencia.
  • Interacción de la levadura y otros ingredientes.
  • En busca de la mejor cerveza, ¿y si bajamos el estrés?

Curso 2: Re-utilización de Levaduras
Curso teórico a cargo del Dr. Diego Libkind. Duración: 2 hs. 30 min
Objetivo:
El mismo está dirigido a productores, profesionales, entusiastas y técnicos del sector, teniendo como objetivo transmitir conocimientos teóricos que permitan la re-utilización en fábrica de las levaduras cerveceras, propiciando así, una mejora en la calidad, productividad, rentabilidad y
diferenciación productiva.
Temas:

  • Re-utilización de levaduras: una práctica milenaria. ¿Por qué no?
  • Beneficios de la re-utilización: casos reales
  • Tips básicos y específicos.
  • Oxígeno para mi levadura = calidad para mi cerveza
  • Experiencia del proyecto PROCAL (Min. Producción) con Cerveceros Barilochenses.
  • Laboratorio cervecero: que necesito para re-utilizar.

Curso 3: Estrategias de control de calidad en fábricas cerveceras artesanales

Aprende las estrategias de inversión más adecuadas para la implementación de técnicas y protocolos de control de calidad en tu emprendimiento cervecero ajustado a tu escala productiva.
Se transmitirá toda la experiencia acumulada de trabajo conjunto entre el IPATEC y las cervecerías patagónicas en lo que refiere a control de calidad fisico-químico y microbiológico, con especial énfasis en control de la fermentación para alcanzar un producto de máxima calidad y estandarizado, haciendo el mejor provecho de los insumos. Se introducirá la aplicación de celular gratuita Microbrew.ar en su nueva versión 2.0 que facilita el control de calidad de la levadura y su seguimiento durante las distintas generaciones de re-utilización. Se revisarán conceptos del impacto de los contaminantes cerveceros y las herramientas para controlarlos.

Workshop EMBO on Integrative Biology: From molecules to ecosystems in extreme environments.

Del 22 al 25 de abril se desarrollará en nuestra Universidad el Workshop EMBO on Integrative Biology: From molecules to ecosystems in extreme environments

El objetivo de este workshop es unir a diferentes expertos chilenos en biodiversidad y extremófilos locales con la experiencia europea en metabolómica, secuenciación masiva, proteómica y biotecnología para desarrollar una serie de modelos de adaptación y evolución a climas y ecosistemas cambiantes.

Esta actividad surge a través de las diferentes investigaciones que se han desarrollado en nuestro país en torno a las condiciones ambientales, ya que Chile tiene algunas de las condiciones ambientales más extremas del mundo. Un ejemplo de ello son las temperaturas del extremo sur o la flora que existe en uno de los desiertos más áridos del mundo.

Además hay que tomar en consideración que existen especies que se han adaptado y evolucionado para sobrevivir en condiciones muy diversas y extremas. Desde poblaciones humanas aisladas en la cima de los andes a mineros en la base y pescadores en la costa; una enorme diversidad en respuesta a condiciones de hipoxia, temperatura y dieta.

El conocimiento adquirido a partir del estudio de esta diversidad de organismos, debería llevar a los diferentes expertos a poder mejorar especies cultivables que puedan sobrevivir el cambio climático, permitir optimizar microorganismos para producir nuevos polímeros o degradar contaminantes y desarrollar mejores mecanismos para tratar la hipoxia y daño de otros estreses ambientales.

Más información en: http://meetings.embo.org/event/19-extreme-environments

Save the date! Molecular Biosystems Conference on Eukaryotic Gene Regulation & Functional Genomics (Sept 30-Oct 4 2019)

Plan to attend the second edition of the “Molecular Biosystems” Conference on Eukaryotic Gene Regulation and Functional Genomics, to be held at the Cabaña del Lago Hotel, in Puerto Varas, Región de Los Lagos, Chile.

The meeting will cover a wide variety of topics centered on eukaryotic gene expression. This conference aims to bring together scientists from all over the world, at different stages of their scientific careers, to discuss recent advances in this active and fast-paced area of research.

This will be a small conference, limited to max. 120 attendees, thus providing a prime opportunity for networking.

Topics covered include:

● Transcriptional Regulation & Chromatin Structure
● Epigenetics
● Genome-Scale & Integrative Biology
● Evolution
● Post-transcriptional Regulation
● Regulatory RNAs
● Developmental Networks & Cell Signaling

Keynote Speakers:

● Lynne E. Maquat (University of Rochester, USA)
●Joseph Ecker (The Salk Institute for Biological Studies, USA)

Organizers:

● Alejandro Montenegro-Montero (John Wiley & Sons, Inc., USA)
● Paulo Canessa (Universidad Andrés Bello, Chile)
● Elena Vidal (Universidad Mayor, Chile)
● Selene Fernandez-Valderde (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad, México).
● Felipe Muñoz-Guzmán (Universidad Finis Terrae, Chile)
● Luis F. Larrondo (Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile)
We hope to see you in Chile’s lake district next September!

Evolución y Genómica Funcional de levaduras

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Fecha: 28 septiembre
Lugar: PUC – Casa Central, Auditorio 15
Hora:  15h30.Los invitamos seminario abierto del Instituto Milenio de Biología Integrativa (IBio) en ‘Evolución y Genómica Funcional de levaduras’ que contará con la participación del Dr Gilles Fischer (Sorbonne Université), experto en evolución y genómica de levaduras,  la Dra Celia Payen (DuPont USA), quien se desempeña en la empresa DuPont y trabaja en mejoramiento genético de levaduras a través de evolución experimental y genómica funcional ademas de Dra Dawn Thompson    (Ginkgo Bioworks) quien dará la charla  “The synergy of rational design, natural genetic variation and evolutionary engineering in a high throughput biological foundry for industrial yeast strain improvement”

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Las levaduras sirven para todo o casi todo, que no es lo mismo, pero es igual

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​José Luis Palacios Pino, Director del Centro de Estudios en Ciencia y Tecnología de los Alimentos (CECTA), tiene el agrado de extenderle la invitación al Conversatorio “Las levaduras sirven para todo o casi todo, que no es lo mismo, pero es igual”, a cargo del Dr. Francisco Salinas, investigador de CECTA y del Instituto Milenio de Biología Integrativa (iBio).

En esta actividad el Dr. Salinas realizará una exposición sobre el uso aplicado de las levaduras en distintos ámbitos productivos y de investigación.

El conversatorio tendrá lugar el viernes 31 de agosto, a las 16:00 horas, en el Edificio de Alimentos, ubicado en Obispo Umaña 050. Para consultas y confirmar asistencia, inscribirse en el siguiente correo: adens.gonzalez@usach.cl.