Workshop iBio III: Introducción al Análisis de RNA-seq en R

 
Este workshop tiene como finalidad capacitar a los miembros del Instituto en el lenguaje de programación R, con el objetivo de usar esta herramienta para analizar datos de RNA-seq. Consiste en 4 sesiones que se realizarán entre el 7 y 15 de Mayo.
 
El workshop empezará con una sesión donde se responderán preguntas relacionadas con el uso básico de R, continuando con un taller de diseño de gráficos en R. La segunda parte del workshop se enfocará en el análisis de datos transcriptómicos. Durante 3 días, los asistentes aprenderán a realizar análisis de expresión diferenciada de datos de RNA-seq obtenidos a partir de distintos diseños experimentales, incluyendo la generación de redes transcripcionales.
 
 
Prerequisito
 
Este workshop requiere que los asistentes auditen este curso online de manejo básico de R. El curso tiene una duración estimada de 4 semanas.
 
 
Programa
 
Sesión 1: Básicos de R.  Por confirmar
  • Consultas curso online de R
 
Sesión 2: Taller de gráficos en R.  Por confirmar
  • Funciones básicas de gráficos
  • Ggplot
  • Heatmaps
 
Sesión 3: Análisis de datos transcripcionales I. Por confirmar
  • RNA-Seq: pre-procesamiento de datos.
  • Análisis temporal de datos transcripcionales.
 
Sesión 4: Análisis de datos transcripcionales II. Por confirmar
  • Análisis de datos transcripcionales, efecto del tratamiento.  (mañana)
  • Análisis de datos transcripcionales con multiples variables. (tarde)
 
Sesión 5: Análisis de datos transcripcionales III. Por confirmar
  • Generación de redes transcripcionales.

Porque plantar árboles

Todas las plantas hacen fotosíntesis, usando dióxido de carbono para producir materia orgánica y oxigeno. De esta forma los arboles secuestran dióxido de carbono, uno de los principales responsables del calentamiento global, desde la atmósfera a medida que crecen.

No solo eso, los arboles nos ayudan a bajar la baja la temperatura de los edificios y casas que se encuentran a su alrededor a través de la evapotranspiración de agua y al darnos sombra  también ayudan a reducir nuestras emisiones de carbono por calefacción (Akbari 2002). También son capaces de capturar monóxido de carbono, dióxido de nitrógeno, dióxido de sulfuro y otros materiales particulados pequeños  (Nowak et al. 2006; Jones et al. 2017). El uso de arboles urbanos y la reforestación si tiene un impacto en el ambiente (Fargione et al. 2018)y nuestra salud (Jones et al. 2017; Bernal et al. 2018).

Luchemos contra la deforestación: Planta por el planeta

Yo planto por el planeta

Porque plantar arboles

Todas las plantas hacen fotosíntesis, secuestrando dióxido de carbono, uno de los principales responsables del calentamiento global.

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Como cuidar tu árbol

Aprende a cuidar tu árbol

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Participa por un Foldscope

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Workshop iBio II: Sesión 7, Práctico de análisis de datos propios

Workshop iBio II: Sesión 6, Análisis funcional de datos omicos

Workshop iBio II: Sesión 5, Introducción a los análisis omicos

Workshop iBio II: Sesión 4, Práctico Familiarización con R

Workshop iBio II: Sesión 3, Programación en R para Bioinformática

Workshop iBio II: Sesión 2, Estadística para Bioinformática.